先天性聋哑是遗传性疾病，有常染色体隐性遗传、常染色体显性遗传和X连锁隐性遗传三种遗传方式。

属于常染色体隐性遗传的又有Ⅰ型和Ⅱ型。Ⅰ型估计有35个基因座，Ⅱ型有6个基因座位。属于常染色体显性遗传的有6个基因座位。属于X连锁隐性遗传的有4个基因座位。因此，常可见到2个先天性聋哑患者婚配后生出并不聋哑的孩子，就是由于父母的聋哑基因不在同一个基因座位所致。由此可见，先天性聋哑具有高度的遗传异质性。如：aaBB(聋哑)×AAbb（聋哑）→AaBb（正常）

先天性聋哑的一种情况是单基因隐性遗传性疾病。本病的一对致病基因中，一个是父方传给的，另一个是母方传给的。先天性聋哑患者都携带有一对致病基因。如果均有致病基因携带者两人互相婚配，其子女就有四分之一的可能是是先天性聋哑患者。如果父母双亲都患有先天性聋哑，互相婚配，由于父母双方基因型均为纯合子，则子女一定患病。