证券清算款是指因买卖证券、回购证券、申购新股、配售股票等业务而发生的，应与证券登记结算机构办理资金清算的款项。如果卖出证券成交总额大于买入证券成交总额为应收证券清算款；如果买入证券成交总额大于卖出证券成交总额为应付证券清算款。

我国《证券投资基金会计核算办法》 中规定。

一、证券清算款科目核算因买卖证券、回购证券、申购新股、配售股票等业务而发生的，应与证券登记结算机构办理资金清算的款项。

二、证券清算款的账务处理。

（一）通过证券交易所买卖证券，证券成交日应分别以下情况进行账务处理。

1、如果买入证券成交总额大于卖出证券成交总额，借记有关科目，贷记本科目和有关科目。

2、如果卖出证券成交总额大于买入证券成交总额，借记本科目和有关科目，贷记有关科目。

（二）通过证券交易所买卖证券，资金交收日应分别以下情况进行账务处理。

1、如果买入证券成交总额大于卖出证券成交总额，按资金交收日实际支付金额（买入证券与卖出证券成交总额的差额，加相关费用），借记本科目，贷记“清算备付金”科目。

2、如果卖出证券成交总额大于买入证券成交总额，按资金交收日实际收到的金额（买入证券与卖出证券成交总额的差额，减相关费用），借记“清算备付金”科目，贷记本科目。

三、本科目应按不同证券登记结算机构，如上海证券中央登记结算公司、深圳证券登记结算有限公司等设置明细账，进行明细核算。

四、本科目所属明细科目期末借方余额反映尚未收回的证券清算款，在资产负债表资产方的“应收证券清算款”项目反映；本科目所属明细科目贷方余额反映尚未支付的证券清算款，在资产负债表负债方的“应付证券清算款”项目反映。