菌丝（hypha），即单条管状细丝，为大多数真菌的结构单位。 它是由孢子萌发成芽管，再由芽管不断生长成丝状或管状的菌体，可以不断地延伸和分枝，有隔膜或无隔膜两种。有隔膜的菌丝称为有隔菌丝，无隔膜的菌丝称为无隔菌丝。 一些原核生物也有菌丝，如放线菌。

菌丝细胞的分裂生长多在每条菌丝的顶端进行。菌丝在基质中或培养基上蔓延伸展，反复分枝网状成菌丝群。 很多菌丝聚集在一起组成真菌的营养体。

菌丝通过顶端生长而延伸，通过侧生而分枝。埋入基质中以吸取营养为主的菌丝称营养菌丝，有的种类还可分化成假根、吸器等构造；伸展在空间的菌丝称气生菌丝，成熟后可分化成各种形式的产孢子构造，如放线菌的孢子丝或真菌中的子实体。

中文名：菌丝

外文名：hypha

意义：单条管状细丝

结构单位：真菌

分类：有隔膜、无隔膜

举例：蕈菌

以蕈菌为例。

菌丝

菌丝细胞是真菌的基本组成单位，圆筒状，一般直径2～4μm，长3～10μm。凡菌丝细胞只有一个核的称单核菌丝细胞，两个核的称双核菌丝细胞，含多核的称多核菌丝细胞。绝大多数蕈菌的菌丝，一般为双核菌丝细胞。蕈菌菌丝细胞壁一般是由几丁质的纤维组成，因其组别不同，几丁质的成分也不同。如子囊菌门的羊肚菌马鞍菌细胞壁几丁质的主要成分是D-半乳糖。担子菌门的蘑菇，香菇等几丁质的成分主要是岩藻糖。此外，还有氨基糖、蛋白质、甘露糖和葡萄糖等。

不论是子囊菌还是担子菌，它们菌丝的横膈膜，在电镜下观察均有小孔，相邻细胞发生细胞质的流通，进行物质、能量及信息的交换。

生长点

菌丝生长点位于菌丝的顶端，呈钝圆锥形，每个分支的顶端都具有生长点。生长点内主要含有浓度很高的原生质和囊泡，有隔真菌生长时，靠近菌丝顶部还有一个易被染色的小体，称为顶体。

生长过程

菌丝

菌丝生长的长度是无限的，但粗细

无隔菌丝

即管状细丝无横隔膜，内含多个细胞生核，低等真菌的菌丝都是无隔菌丝 。无隔菌丝可视为一个单细胞，具有多个细胞核，如低等真菌中的根霉、毛霉、水霉等的菌丝。

有隔菌丝

即菌丝具很多横隔壁，将其分隔成多个细胞，每个细胞中有1个、2个或多个细胞核。如青霉、曲霉、蘑菇等的菌丝 。但是有隔菌丝的横隔膜在结构上还存在很多差异，如有的横隔膜为全封闭式的，有的横隔膜在中央有1个小孔，有的具多个小孔，还有的为隔膜中央的小孔边缘增厚，形成桶状，称做桶孔隔膜等。

放线菌菌丝

放线菌

基内菌丝

基内菌丝匍匐生长于营养基质表面或伸向基质内部，它们象植物的根一样，具有吸收水分和养分的功能。有些还能产生各种色素，把培养基染成各种美丽的颜色。

放线菌中多数种类的基内菌丝无隔膜，不断裂，如链霉菌属和小单孢菌属等；但有一类放线菌，如诺卡氏菌型放线菌的基内菌丝生长一定时间后形成横隔膜，继而断裂成球状或杆状小体。

气生菌丝

气生菌丝是基内菌丝长出培养基外并伸向空间的菌丝。在显微镜下观察时，一般气生菌丝颜色较深，比基内菌丝粗；而基内菌丝色浅、发亮。有些放线菌气生菌丝发达，有些则稀疏，还有的种类无气生菌丝。

菌丝是食用菌的营养体。