植物性雌激素与雌激素的结构不同，但药效团在骨架上排列的空间距离和分布、电荷性质、刚性和疏水性都比较相似，即不同骨架支撑相同或相似的排布。

植物性雌激素可与雌激素受体结合，发生弱雌激素作用，起到防治骨质疏松的作用，而又避免了强效雌激素引发的副作用，如子宫内膜癌等。植物雌激素包括黄酮（Flavones）、异黄酮（Isoflavones）、二氢黄酮（Flavanones）、黄酮醇（Flavonols）、香豆素（Coumestans）、木脂素（Lignans）等。20世纪90年代初，日本武田公司开发上市了依普黄酮（Ipriflavone），商品名为“Osten”，适用于骨质疏松症；该化合物是异黄酮衍生物，结构与雌二醇相似，与雌激素受体结合而发挥作用。在体内雌激素诱导下，使甲状腺细胞分泌降钙素而抑制破骨细胞生成，但其绝经后骨质疏松症的疗效却不及雷洛昔芬。依普黄酮具有很强的心血管保护作用。