颚足纲 Maxillopoda

鞘甲亚纲 Thecostraca

带甲下纲 Facetotecta

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囊胸下纲 Ascothoracida

长囊虱目 Laurida

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树囊虱目 Dendrogastrida

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蔓足下纲 Cirripedia

尖胸总目 Acrothoracica

有肛目 Pygophora

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无肛目 Apygophora

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根头总目 Rhizocephala

有刺胞幼体目 Kentrogonida

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无刺胞幼体目 Akentrogonida

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围胸总目Thoracica

有柄目 Pedunculata

异茗荷亚目

异茗荷科 Heteralepadidae

鞘茗荷科 Koleolepadidae

鸟嘴亚目 Iblomorpjha

鸟嘴科 Iblidae

茗荷亚目 Lepadomorpha

刺茗荷科 Oxynaspididae

花茗荷科 Poecilasmatidae

茗荷科 Lepadidae

铠茗荷亚目 Scalpellomorpha

盔茗荷科 Calanticidae

指茗荷科 Pollicipidae

石茗荷科 Lithotryidae

铠茗荷科 Scalpellidae

无柄目 Sessilia

短茗荷亚目

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花笼亚目 Verrucomorpha

花笼科 Verrucidae

藤壶亚目 Balanomorpha

厚板藤壶科 Pachylasmatidae

小藤壶科 Chthamalidae

龟藤壶科 Chelonibiidae

扁藤壶科 Platylepadidae

鲸藤壶科 Coronulidae

深板藤壶科 Bathylasmatidae

笠藤壶科 Tetraclitidae

古藤壶科 Archaeobalanidae

塔藤壶科 Pyrgomatidae

藤壶科 Balanidae

微虾亚纲 Tantulocarida

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鳃尾亚纲 Branchiura

鲺目 Argulidea

鲺科 Argulidae

舌形亚纲 Pentasomida

头节目 Cephalobaenida

头节科 Cephalobaenidae

Reighardiidae

孔头虫目 Porocephalida

蛇舌形虫科 Armilliferidae

Diesingidae

舌形虫科 Linguatulidae

孔头虫科 Porocephalidae

塞波科 Sambonidae

Sebekiidae

Subtriquetridae

须虾亚纲 Mystacocarida

须虾目 Mystacocaridida

长唇虾科

桡足亚纲 Copepoda

原裸甲下纲 Progymnoplea

扁桡足目 Platycopioida

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新桡足下纲 Neocopepoda

裸甲总目 Gymnoplea

哲水蚤目 Calanoida

纺锤水蚤科 Acartiidae

鹰嘴水蚤科 Aetideidae

尖头水蚤科 Arietellidae

亮羽水蚤科 Augaptilidae

深海水蚤科 Bathypontiidae

Boholinidae

哲水蚤科 Calanidae

平头水蚤科 Candaciidae

胸刺水蚤科 Centropagidae

Clausocalanidae

Diaixidae

镖水蚤科 Diaptomidae

Discoidae

Epacteriscidae

真哲水蚤科 Eucalanidae

真刺水蚤科 Euchaetidae

异肢水蚤科 Heterorhabdidae

Hyperbionychidae

光水蚤科 Lucicutiidae

Mecynoceridae

Megacalanidae

Mesaiokeratidae

长腹水蚤科 Metridinidae

Nullosetigeridae

拟哲水蚤科 Paracalanidae

拟角水蚤科 Parapontellidae

Parkiidae

褐水蚤科 Phaennidae

角水蚤科 Pontellidae

伪剑水蚤科 Pseudocyclopidae

侧剑水蚤科 Pseudocyclopiidae

伪镖水蚤科 Pseudodiaptomidae

Ridgewayiidae

Ryocalanidae

厚壳水蚤科 Scolecitrichidae

刺哲水蚤科 Spinocalanidae

冠水蚤科 Stephidae

Subeucalanidae

Sulcanidae

宽水蚤科 Temoridae

毛颚水蚤科 Tharybidae

歪水蚤科 Tortanidae

足甲总目 Podoplea

小虱水蚤目 Misophrioida

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剑水蚤目 Cyclopoida

Archinotodelphyidae

Ascidicolidae

Buproridae

Chordeumiidae

Cucumaricolidae

剑水蚤科 Cyclopidae

镖剑水蚤科 Cyclopinidae

Fratiidae

锚头剑水蚤科 Lernaeidae

Mantridae

Notodelphyidae

长腹剑水蚤科 Oithonidae

Ozmanidae

Speleoithonidae

Thaumatopsyllidae

凝水蚤目（ 隐水蚤目 ）Gelyelloida

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摩门水蚤目 Mormonilloida

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猛水蚤目 Harpacticoida

Adenopleurellidae

保猛水蚤科 Aegisthidae

阿玛猛水蚤科 Ameiridae

Ancorabolidae

Arenopontiidae

Argestidae

Balaenophilidae

Cancrincolidae

异足猛水蚤科 Canthocamptidae

灰白猛水蚤科 Canuellidae

黄褐猛水蚤科 Cerviniidae

Chappuisiidae

短角猛水蚤科 Cletodidae

Cletopsyllidae

盔头猛水蚤科 Clytemnestridae

Cristacoxidae

圆筒猛水蚤科

Dactylopusiidae

Danielsseniidae

拟蠕猛水蚤科

同相猛水蚤科 Ectinosomatidae

Euterpinidae

Hamondiidae

猛水蚤科 Harpacticidae

Huntemanniidae

老丰猛水蚤科 Laophontidae

Laophontopsidae

Latiremidae

Leptastacidae

Leptopontiidae

长肢猛水蚤科 Longipediidae

Louriniidae

后猛水蚤科 Metidae

大星猛水蚤科 Miraciidae

新懒猛水蚤科 Neobradyidae

Normanellidae

Novocriniidae

Orthopsyllidae

Parameiropsidae

Paramesochridae

Paranannopidae

Parastenheliidae

苗条猛水蚤科

Parastentheliidae

龟甲猛水蚤科 Peltidiidae

叶颚猛水蚤科

Porcellidiidae

Protolatiremidae

伪大吉猛水蚤科

Rhizothricidae

Rhynchothalestridae

Rometidae

Rotundiclipeidae

Superornatiremidae

大吉猛水蚤科 Tachidiidae

Tegastidae

Tetragonicipitidae

神仙猛水蚤科 Thalestridae

Thompsonulidae

泰斯猛水蚤科 Tisbidae

鞘口目 Poecilostomatoida

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管口目 Siphonostomatoida

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怪水蚤目 Monstrilloida

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